小龍蝦的疾病主要由生物因素和非生物因素引起。非生物因素引起的疾病，是指因缺氧、溫度過高或過低、龍蝦養殖水體pH值過高或過低、農藥等有毒有害物質污染水體而引起的疾病。生物因素引起的疾病，是指在小龍蝦養殖過程中，由病毒、細菌、真菌、原生動物等有害病原體引起的疾病，以及飼料不足引起的營養不良、操作不當引起的應激反應等疾病。

疾病是一個復雜的生理過程。許多疾病是上述兩個因素協同作用的結果。由于小龍蝦具有較強的適應性和抗病性，發生大規模疾病的概率很小。目前，我國天然水域和池塘中的小龍蝦大面積病害很少，主要是敵害。然而，在池塘高密度養殖小龍蝦時，放養密度可能相對較大。因此,在防敵的同時,還要加強防病工作。在小龍蝦養殖技術和生產過程中，預防疾病和危害的主要措施如下：

1、 在飼養龍蝦種苗之前，池塘應該嚴格消毒，這就是我們通常所說的清理池塘；

2、龍蝦養殖時，將蝦苗浸泡在3-4%的鹽溶液中10分鐘，以消毒蝦體。浸泡時，搖動容器，達到更好的消毒效果；

3、 加強水池水質管理，定期補充新水，調整水池水質。如有可能，可定期向整個池塘噴灑生石灰，或定期噴灑光合細菌，以消除養殖水體中的氨氮、亞硝酸鹽、硫化氫等有害物質，保持池塘水pH值和溶解氧水平的平衡，保持水體物質良性循環，解決池水老化等問題。一般情況下，光螯細菌在小龍蝦養殖中后期一個月應用一次，每次劑量為每立方米5-6克水；

4、 飼料應新鮮，飼料不腐爛，可在復合飼料中添加光合細菌和免疫制劑；

5、 在進出口和池脊處設置蚊帳，嚴防敵害生物進入。蝦池內如發現鯰魚、蛇頭、鱖魚、青蛙、蟾蜍、水蛇、泥鰍、黃鱔、水鼠等敵害生物，應及時采取措施予以清除；

6、 采用生態健康的龍蝦養殖技術和方法。